25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1685 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1685  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  181  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4845  hypothetical protein  83.33 
 
 		 86 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131883  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1789  hypothetical protein  55.56 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2125  hypothetical protein  55.56 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1719  cyclic-AMP phosphodiesterase  53.33 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4042  hypothetical protein  61.9 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3271  conserved hypothetical protein; putative exported protein  45.12 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49176  normal  0.929247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6927  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0120246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6274  hypothetical protein  46.91 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.090037  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1183  hypothetical protein  51.56 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.632073  normal  0.060455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1341  hypothetical protein  51.56 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5391  hypothetical protein  43.66 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.292263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  41.25 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1341  hypothetical protein  41.18 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5579  hypothetical protein  42.42 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3297  hypothetical protein  48.21 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3072  hypothetical protein  48.21 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0168  hypothetical protein  44.12 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0497  hypothetical protein  42.42 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0292  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0873  hypothetical protein  40.91 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0626163  hitchhiker  0.000582334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0875  hypothetical protein  41.51 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0900  hypothetical protein  37.74 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.618988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0938  hypothetical protein  37.74 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.67682  normal  0.108929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>