244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1901 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1901  Rhodanese domain protein  100 
 
 
159 aa  337  4e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2099  Rhodanese domain protein  46.84 
 
 
191 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0523024  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1575  rhodanese domain-containing protein  46.1 
 
 
154 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00593854  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1444  Rhodanese domain protein  46.1 
 
 
154 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000128878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4822  Rhodanese domain protein  33.08 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 
116 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  35.65 
 
 
144 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  26.92 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
129 aa  57.4  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  34.78 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  28.32 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 
111 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.96 
 
 
397 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  33.05 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 
112 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  28.68 
 
 
140 aa  54.3  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.9 
 
 
387 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.26 
 
 
400 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.26 
 
 
400 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.26 
 
 
400 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  31.15 
 
 
423 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  29.2 
 
 
391 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05030  hypothetical protein  28.57 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.48 
 
 
392 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  32.43 
 
 
390 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  31.01 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.82 
 
 
383 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  31.3 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  32.73 
 
 
110 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.82 
 
 
383 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  28.57 
 
 
387 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  26.89 
 
 
116 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  30.43 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 
106 aa  51.6  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 
127 aa  51.2  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  30.91 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.43 
 
 
390 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  30.28 
 
 
390 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  26.89 
 
 
129 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.53 
 
 
390 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.07 
 
 
390 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2905  hypothetical protein  30.09 
 
 
390 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3191  hypothetical protein  30.09 
 
 
390 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.755733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  31.13 
 
 
472 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.63 
 
 
393 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  32.35 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.48 
 
 
395 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.48 
 
 
392 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  30.84 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  33.63 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  30.09 
 
 
480 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  33.63 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  33.63 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  28.21 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  33.63 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.41 
 
 
392 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.39 
 
 
386 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  28.18 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.41 
 
 
388 aa  48.5  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  27.43 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  26.89 
 
 
141 aa  48.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  27.35 
 
 
390 aa  48.5  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.56 
 
 
393 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  32.74 
 
 
175 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 
125 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.78 
 
 
390 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  27.43 
 
 
114 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 
111 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  28.95 
 
 
391 aa  47.8  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.83 
 
 
399 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  36.14 
 
 
271 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  26.55 
 
 
115 aa  47.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
379 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  29.31 
 
 
222 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 
480 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  26.26 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  27.83 
 
 
393 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2261  sulfurtransferase  32.08 
 
 
271 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  28.04 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0446  Rhodanese domain protein  24.66 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  26.4 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  26.4 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  28.15 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  27.12 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  34.04 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31.91 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  27.73 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  28.7 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  28.78 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  31.3 
 
 
220 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  31.93 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  27.12 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  29.82 
 
 
247 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  31.03 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  31.93 
 
 
116 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 
110 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>