38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1650 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1650  rhodanese-like protein  100 
 
 		 217 aa  448  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000948932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1028  Rhodanese domain protein  60.3 
 
 		 237 aa  260  8.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186983  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1668  rhodanese-like protein  55.87 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1543  rhodanese domain-containing protein  48.45 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1735  rhodanese-like protein  40.47 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4882  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 191 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.70517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2268  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 191 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  normal  0.0852757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1929  rhodanese-like protein  40.85 
 
 		 188 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.6245300000000003e-19  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3711  rhodanese domain-containing protein  37.32 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0309402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.79 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  28.03 
 
 		 162 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  25.2 
 
 		 112 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  25.86 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  23.48 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  24.11 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  23.36 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  25 
 
 		 112 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  24.22 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1422  rhodanese domain-containing protein  30.6 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  21.71 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  24.37 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  26.32 
 
 		 300 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 		 287 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 189 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  31.25 
 
 		 393 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  26.42 
 
 		 172 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  30 
 
 		 665 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 137 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  25.22 
 
 		 454 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 233 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  29.25 
 
 		 291 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 295 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>