73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1543 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1543  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1650  rhodanese-like protein  45.66 
 
 
217 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000948932  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1668  rhodanese-like protein  48.69 
 
 
218 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1028  Rhodanese domain protein  44 
 
 
237 aa  170  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1735  rhodanese-like protein  38.89 
 
 
241 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 
211 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1929  rhodanese-like protein  40.3 
 
 
188 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.6245300000000003e-19  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3711  rhodanese domain-containing protein  32.8 
 
 
195 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0309402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2268  rhodanese domain-containing protein  35.68 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  normal  0.0852757 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4882  rhodanese domain-containing protein  35.68 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.70517 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  31.65 
 
 
162 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  35.19 
 
 
247 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  34.21 
 
 
112 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  30.83 
 
 
380 aa  55.5  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  26.45 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  30.47 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
124 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
124 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
227 aa  48.5  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 
218 aa  48.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
224 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  31.45 
 
 
291 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  30.84 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  25.71 
 
 
148 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  29.6 
 
 
112 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  26.28 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  21.95 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 
153 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  26.09 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
300 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  25.2 
 
 
144 aa  45.1  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  31.19 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  25.89 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
130 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  24.56 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 
132 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  28.69 
 
 
143 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  30.51 
 
 
285 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
134 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  24.46 
 
 
136 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 
132 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  27.81 
 
 
170 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 
144 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  30.77 
 
 
293 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  23.65 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 
136 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
130 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  30.93 
 
 
174 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  30.16 
 
 
141 aa  42  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  27.55 
 
 
133 aa  41.6  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  28.3 
 
 
113 aa  41.6  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  27.97 
 
 
123 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  28.57 
 
 
286 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 
155 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 
155 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>