More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5025 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  94.39 
 
 		 107 aa  207  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  94.39 
 
 		 107 aa  207  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  75.47 
 
 		 106 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  69.81 
 
 		 106 aa  150  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  67.92 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  53.77 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  46.67 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  46.23 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  45.71 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  44.76 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  45.79 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  47.12 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  43.93 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  45.54 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  44.76 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  45.05 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  43.68 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  39.81 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  36.94 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  33.98 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  36.21 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  38.05 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  34.29 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  37.5 
 
 		 346 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  37.61 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  39.42 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  38.61 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  35.11 
 
 		 665 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  35.71 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3005  Rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.603948  normal  0.106826 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  34.29 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  37.89 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  35.42 
 
 		 389 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 		 361 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  38.32 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  34.02 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  35.79 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  30.84 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3170  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 224 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  34.78 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.21 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.37 
 
 		 392 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.87 
 
 		 201 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.96 
 
 		 390 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  34.88 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.25 
 
 		 390 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.94 
 
 		 386 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.55 
 
 		 400 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  34.29 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  35.35 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.55 
 
 		 400 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  35.85 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.05 
 
 		 387 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.23 
 
 		 403 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.55 
 
 		 400 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.12 
 
 		 397 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  27.45 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13503  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.56 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.258058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  40.48 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  32.58 
 
 		 393 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  37.62 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  29.41 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.29 
 
 		 390 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 		 344 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 		 118 aa  47.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  29.76 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  40.22 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>