More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1261 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1261  Rhodanese domain protein  100 
 
 
111 aa  224  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1401  Rhodanese domain protein  48.31 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.328336  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3581  Rhodanese domain protein  42.57 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1590  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0605  Rhodanese domain protein  44.95 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.245257  normal  0.38785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  37.35 
 
 
288 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  40 
 
 
277 aa  62  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  35.71 
 
 
201 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 
220 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1600  Rhodanese domain protein  33.63 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00548753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 
278 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31.31 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 
284 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  31.4 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  35.51 
 
 
198 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 
282 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  27.43 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  32.29 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  30.39 
 
 
189 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
221 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  32 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
224 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
216 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
226 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  29.7 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 
290 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  27.08 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  33 
 
 
478 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  28.28 
 
 
112 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 
226 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  32 
 
 
478 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32 
 
 
484 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  32 
 
 
478 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  32 
 
 
478 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
218 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  28 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32 
 
 
484 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  35 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  29.41 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
223 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  34.92 
 
 
218 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 
463 aa  52  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01140  URM1 activating enzyme, putative  31.48 
 
 
415 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
222 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
223 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
227 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
550 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 
145 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
230 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
235 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
235 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  27.45 
 
 
104 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
235 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  27 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.93 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  26.04 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  30.34 
 
 
280 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  40.74 
 
 
711 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  29.03 
 
 
146 aa  50.8  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  29.03 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 
459 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  33.77 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  29.7 
 
 
459 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  29.81 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 
459 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
197 aa  50.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  34 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>