More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1600 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1600  Rhodanese domain protein  100 
 
 
140 aa  274  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00548753 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1590  Rhodanese domain protein  47.89 
 
 
132 aa  126  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3581  Rhodanese domain protein  47.86 
 
 
121 aa  122  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0605  Rhodanese domain protein  43.57 
 
 
126 aa  98.6  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.245257  normal  0.38785 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1401  Rhodanese domain protein  44.14 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.328336  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1261  Rhodanese domain protein  33.63 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
277 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  36.11 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 
170 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
277 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
279 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.51 
 
 
393 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  38.37 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  32.41 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  34.26 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
107 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
107 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  35.96 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  37.21 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0809  rhodanese domain-containing protein  30.19 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.321585  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  31.11 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  37.21 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  39.24 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  37.21 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  31.4 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  29.25 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  37.21 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  37.21 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  37.65 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
278 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  35.8 
 
 
113 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  35.8 
 
 
102 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.9 
 
 
280 aa  51.2  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  36.78 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  35.37 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  32.69 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  32.93 
 
 
288 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  31.48 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
282 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  32.73 
 
 
389 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 
149 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  32.91 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  38.55 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.23 
 
 
346 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  31.48 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
101 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
101 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
101 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 
101 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  38.75 
 
 
711 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  37.04 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  30.56 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  30.61 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  30.58 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  35.56 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
325 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  34.18 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0417  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  32.35 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
263 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  33 
 
 
459 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  27.27 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  28.41 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1554  rhodanese-like sulfurtransferase protein  29.07 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000229638  normal  0.157594 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  29.41 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 
284 aa  47.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  32.93 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  30.19 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>