29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21480 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  68.04 
 
 		 197 aa  280  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  67.01 
 
 		 196 aa  267  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  60.62 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  57.44 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1132  hypothetical protein  56.48 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  46.56 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  47.02 
 
 		 196 aa  147  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  46.67 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  46.71 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  44.64 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  40.61 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 739 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  39.46 
 
 		 774 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  29.17 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1475  cupin region  34.51 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0450  cupin region  33.72 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0601879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2632  cupin region  34.52 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0656  cupin 2 domain-containing protein  27.81 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0676  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily  26.63 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4624  cupin 2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000467504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3954  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2513  cysteine dioxygenase type I  29.61 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3194  hypothetical protein  28.04 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5454  hypothetical protein  29.91 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  29.71 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  30.97 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  32.18 
 
 		 171 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>