24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3194 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3194  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  38.24 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0527  hypothetical protein  28.99 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0551  hypothetical protein  27.5 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3973  hypothetical protein  30.3 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4137  hypothetical protein  30.3 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0744352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2042  hypothetical protein  34.34 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0184713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0275  hypothetical protein  31.63 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1885  cysteine dioxygenase type I  35.64 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  32.67 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3934  hypothetical protein  32.48 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3162  hypothetical protein  36.78 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3601  hypothetical protein  28.7 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5773  hypothetical protein  29.03 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000274794 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5233  cysteine dioxygenase type I  31.18 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.220688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2660  hypothetical protein  24.26 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000212284  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0862  hypothetical protein  28.15 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3482  hypothetical protein  29.57 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206072  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2631  hypothetical protein  37.08 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00987112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21480  hypothetical protein  28.04 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  32.65 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.221048 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1548  cysteine dioxygenase type I  27.68 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1793  hypothetical protein  27.72 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3216  hypothetical protein  24.42 
 
 		 202 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.460975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>