55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2356 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2356  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  413  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  92.96 
 
 		 454 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  31.14 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  40.28 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  30.14 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 		 271 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  43.08 
 
 		 247 aa  51.2  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  40.3 
 
 		 377 aa  51.2  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  25.52 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  25.45 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  36.51 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1401  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 107 aa  46.2  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.328336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2992  rhodanese-like domain-containing protein  32.35 
 
 		 95 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  45.65 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  24.11 
 
 		 221 aa  45.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  44.26 
 
 		 252 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  47.17 
 
 		 406 aa  44.7  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 98 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  28.95 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 		 124 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  37.31 
 
 		 284 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 124 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 459 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2857  rhodanese domain-containing protein  32.76 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.871228  normal  0.0137642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  45.65 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  30.65 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1394  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 		 136 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 		 432 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01140  URM1 activating enzyme, putative  43.48 
 
 		 415 aa  42.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1430  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45 
 
 		 569 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0585  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.06 
 
 		 569 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  26.32 
 
 		 150 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 296 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 228 aa  42  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 221 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 227 aa  42  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 107 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  32.81 
 
 		 117 aa  41.6  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 		 581 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.29 
 
 		 562 aa  41.2  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>