More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2294 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2294  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  100 
 
 		 402 aa  823    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.732113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3409  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  70.39 
 
 		 426 aa  583  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0443219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1601  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  71.11 
 
 		 415 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2273  cystathionine beta-lyase  70.86 
 
 		 415 aa  570  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302386  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3021  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  71.36 
 
 		 413 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  68.32 
 
 		 397 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  67.66 
 
 		 422 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  67.51 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  61.43 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  60.2 
 
 		 396 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2056  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  60.35 
 
 		 399 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  51.76 
 
 		 394 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  52.5 
 
 		 469 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  51.51 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  52.5 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  52.5 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  52.5 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  52.5 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  52.25 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  52.5 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  52 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  50.5 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  50.5 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  50.5 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  52.48 
 
 		 394 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  50.38 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  50.25 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  49.62 
 
 		 394 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  50 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  48.45 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  48.97 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  48 
 
 		 403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  48.36 
 
 		 403 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  48.36 
 
 		 404 aa  332  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  39.54 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  40.31 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2139  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  39.84 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  38.19 
 
 		 431 aa  249  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  39.21 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  38.1 
 
 		 388 aa  245  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2381  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  37.73 
 
 		 393 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  38.02 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  37.5 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  37.5 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  38.06 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  38.04 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  37.56 
 
 		 469 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  39.95 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4431  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  38.38 
 
 		 407 aa  237  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2554  cystathionine beta-lyase  39.9 
 
 		 410 aa  236  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  41.27 
 
 		 398 aa  235  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  37.12 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  39.05 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  37.7 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  38.48 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  36.62 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  40.36 
 
 		 400 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  38.16 
 
 		 399 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  38.44 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  38.27 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  37.28 
 
 		 396 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  36.62 
 
 		 389 aa  229  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  38.28 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  36.32 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  39.15 
 
 		 896 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  35.11 
 
 		 395 aa  225  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  37.37 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  33.69 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  37.7 
 
 		 388 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  35.64 
 
 		 401 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  36.66 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  35.56 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  35.56 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3477  cystathionine beta-lyase  38.52 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  36.05 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  36.02 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  39.77 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  36.58 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  36.57 
 
 		 416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  35.86 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  35.68 
 
 		 388 aa  219  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  36.31 
 
 		 396 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  36.12 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  34.22 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  37.43 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  37.34 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  35.28 
 
 		 418 aa  216  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  37.31 
 
 		 400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  40.68 
 
 		 396 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  35.88 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  33.06 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  32.17 
 
 		 395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  33.86 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3418  cystathionine beta-lyase  32.42 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0475  cystathionine beta-lyase  33.85 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.715777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  33.06 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  34.95 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  35.48 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>