76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_34290  Rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
178 aa  331  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.128356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  45.83 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  38.33 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  34.75 
 
 
134 aa  61.6  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 
131 aa  61.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  38.76 
 
 
140 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  35.77 
 
 
163 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
130 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  40.38 
 
 
107 aa  51.2  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  33.59 
 
 
131 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
127 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 
133 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  43.4 
 
 
143 aa  48.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.66 
 
 
220 aa  48.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5002  rhodanese domain-containing protein  40.86 
 
 
104 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.589759  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  34.95 
 
 
140 aa  48.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 
480 aa  47.8  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  34.19 
 
 
294 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
140 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.9 
 
 
378 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  37.5 
 
 
148 aa  45.4  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  28.33 
 
 
149 aa  45.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  31.19 
 
 
106 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 
112 aa  44.7  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  33.33 
 
 
141 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 
126 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
144 aa  44.7  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0755  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  28.83 
 
 
110 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.83 
 
 
379 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.07 
 
 
380 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.83 
 
 
386 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  37.25 
 
 
106 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  31.37 
 
 
110 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  36.54 
 
 
106 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
406 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
123 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  29.25 
 
 
103 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  28.83 
 
 
110 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  35.38 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  47.5 
 
 
106 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  31.82 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  29.81 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  47.83 
 
 
438 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.43 
 
 
379 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.43 
 
 
379 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  35.42 
 
 
106 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2738  rhodanese-related sulfurtransferase  33.58 
 
 
315 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.848314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  30.47 
 
 
130 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  39.53 
 
 
100 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  41.3 
 
 
158 aa  42  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  26.67 
 
 
145 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  41.3 
 
 
118 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  30.83 
 
 
138 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  26.42 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
121 aa  41.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  47.92 
 
 
113 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  29.73 
 
 
109 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1396  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 
315 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260045  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  40 
 
 
103 aa  40.8  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
140 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  31.91 
 
 
144 aa  41.2  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
140 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  45.24 
 
 
110 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  45.24 
 
 
110 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  52.94 
 
 
541 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  28.07 
 
 
153 aa  40.8  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  45 
 
 
109 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  55.56 
 
 
568 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  55.56 
 
 
568 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  28.8 
 
 
142 aa  40.8  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>