38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1272 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1272  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0457  Rhodanese domain protein  71.2 
 
 		 126 aa  186  9e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314703  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  30.21 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0918  Rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.112795 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  33.77 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 		 375 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  26.37 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1188  Rhodanese domain protein  32.94 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  31.03 
 
 		 363 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  34.41 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0795  rhodanese-like domain-containing protein  29.21 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1579  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  32.63 
 
 		 566 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  27.91 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  29.33 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  27.84 
 
 		 146 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  27.84 
 
 		 146 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  28.18 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0541  hypothetical protein  31.87 
 
 		 598 aa  41.6  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.360191  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  30.34 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  28.3 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 		 406 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 		 454 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  28.41 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3484  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.11 
 
 		 561 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  31.13 
 
 		 172 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5002  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.589759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  26.74 
 
 		 138 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>