More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1744 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1744  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 112 aa  226  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.664688  normal  0.136709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  43.3 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  45.57 
 
 		 361 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.04 
 
 		 389 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.14 
 
 		 480 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  33.03 
 
 		 354 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  33.33 
 
 		 896 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.03 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  42.39 
 
 		 459 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  42.39 
 
 		 459 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  35.78 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2558  rhodanese-like domain protein  42.05 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.029677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  41.77 
 
 		 459 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  35.71 
 
 		 280 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2188  Rhodanese domain protein  42.05 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0415469  hitchhiker  0.000000235552 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  37.66 
 
 		 277 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  32.11 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  41.33 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.11 
 
 		 346 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  36.73 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  31.78 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.69 
 
 		 393 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.26 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.46 
 
 		 550 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  32 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  30.56 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 		 227 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 		 459 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  39.6 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  39.13 
 
 		 459 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 		 459 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 		 352 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  35.63 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  28.97 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  40.51 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  39.29 
 
 		 247 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  39.02 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  38.82 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  42.22 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  36.08 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  31.46 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  40 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  30.11 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 		 277 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 529 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 459 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  32.14 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  30.43 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  33.98 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  39.74 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2246  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00449361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  34.65 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  33.98 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 529 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  32.5 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  30.91 
 
 		 931 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.71 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 		 471 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  37.8 
 
 		 377 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  33.64 
 
 		 548 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  30.3 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>