32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1257 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  193  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  52.56 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  55.13 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  39.51 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  37.04 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  35.8 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  42.5 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  42.5 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  33.77 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  41.25 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  42.47 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  43.84 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  35.53 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  39.73 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  36.49 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  38.82 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  35.8 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  40.26 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  40.51 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  34.57 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  32.18 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  38.96 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 128 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  32 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>