84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0373 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0373  rhodanese-like  100 
 
 
181 aa  373  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1529  rhodanese-like protein  36.2 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155027  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2329  Rhodanese domain protein  39.33 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3127  hypothetical protein  35.33 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154894  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0955  rhodanese-like protein  42.64 
 
 
271 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0394414  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3551  hypothetical protein  35.29 
 
 
222 aa  99.8  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3209  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0624  Rhodanese domain protein  29.75 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1490  rhodanese domain-containing protein  30.46 
 
 
136 aa  62.4  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1274  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
135 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0733136  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0117  rhodanese-like protein  33.08 
 
 
130 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0687  rhodanese domain-containing protein  28.86 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0151  rhodanese-like domain protein  29.53 
 
 
132 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0322  Rhodanese domain protein  29.53 
 
 
132 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.089082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  31.08 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2446  rhodanese-like protein  28.38 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000105937  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1742  Rhodanese domain protein  27.89 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.354198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0086  rhodanese-like protein  29.41 
 
 
130 aa  55.1  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  26.39 
 
 
130 aa  54.7  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1890  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0002  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 
149 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000108771  hitchhiker  1.00132e-23 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10394  hypothetical protein  26.85 
 
 
140 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112032  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2535  Rhodanese domain protein  28 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.607232  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3119  Rhodanese domain protein  29.8 
 
 
160 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1556  hypothetical protein  30.61 
 
 
155 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0235  rhodanese-like protein  24.83 
 
 
128 aa  52  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.661399  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0512  Rhodanese domain protein  29.68 
 
 
152 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00637526  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2946  Rhodanese domain protein  28.48 
 
 
147 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0296  hypothetical protein  31.5 
 
 
130 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0157  Rhodanese domain protein  33.08 
 
 
130 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0150  Rhodanese domain protein  29.92 
 
 
130 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2626  rhodanese-like protein  28.97 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3513  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0120  rhodanese-like domain-containing protein  28.66 
 
 
155 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4005  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816307  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0535  Rhodanese domain protein  27.21 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2139  rhodanese-like protein  29.25 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109425  decreased coverage  0.0000830085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0220  rhodanese domain-containing protein  28.86 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0171  rhodanese-like protein  27.4 
 
 
145 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0027  hypothetical protein  28.38 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.335991  normal  0.134752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5503  Rhodanese domain protein  29.22 
 
 
146 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2287  rhodanese-like protein  27.01 
 
 
209 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2167  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.548621  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3644  Rhodanese domain protein  30.41 
 
 
136 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1822  rhodanese domain-containing protein  27.89 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1909  rhodanese/Cdc25 fold  27.89 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.636231  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0195  rhodanese-like domain-containing protein  27.89 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  27.89 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0929  rhodanese-like domain-containing protein  27.89 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0366  rhodanese-like domain-containing protein  27.89 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0452  rhodanese-like domain-containing protein  27.89 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.401061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0532  rhodanese domain-containing protein  28.47 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210744  normal  0.0949792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0538  rhodanese domain-containing protein  27.74 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2616  Rhodanese domain protein  26.49 
 
 
154 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00605824  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0515  rhodanese domain-containing protein  27.52 
 
 
137 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3646  Rhodanese domain protein  26.9 
 
 
150 aa  44.7  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1456  hypothetical protein  50 
 
 
379 aa  44.3  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  29.73 
 
 
368 aa  44.3  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  29.73 
 
 
368 aa  44.3  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1482  hypothetical protein  29.14 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1527  hypothetical protein  50 
 
 
379 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35020  Rhodanese-related sulfurtransferase  30.87 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  40 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2168  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.784132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4172  rhodanese domain-containing protein  27.21 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.170844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0537  rhodanese domain-containing protein  26.85 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0661648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0525  rhodanese-like protein  26.85 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2150  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 
154 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5927  rhodanese-like protein  35.37 
 
 
154 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0548  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3859  rhodanese domain-containing protein  31.08 
 
 
136 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3613  rhodanese-like protein  28.03 
 
 
160 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1843  rhodanese-like domain-containing protein  28.57 
 
 
154 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5459  rhodanese-like protein  34.15 
 
 
154 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2187  rhodanese domain-containing protein  31.75 
 
 
182 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.992479  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2060  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 
154 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  29.92 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1520  hypothetical protein  25.17 
 
 
154 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000699946  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5788  rhodanese domain-containing protein  27.03 
 
 
159 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00528237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1177  Rhodanese domain protein  29.13 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1085  Rhodanese domain protein  29.13 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  29.13 
 
 
146 aa  41.2  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  29.13 
 
 
146 aa  41.2  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3372  rhodanese-related sulfurtransferase  27.27 
 
 
149 aa  41.2  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>