184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0924 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  343  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  65.14 
 
 		 175 aa  227  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  52.05 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  51.43 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  51.43 
 
 		 175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  51.43 
 
 		 175 aa  163  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  51.43 
 
 		 175 aa  163  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  51.43 
 
 		 175 aa  163  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  51.76 
 
 		 168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 178 aa  160  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  48.31 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  48.31 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  48.31 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  48.31 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  48.31 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  48 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  47.43 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  47.16 
 
 		 172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  47.19 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  45.88 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  48 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  40.46 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  37.29 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  38.99 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  37.66 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  32.3 
 
 		 190 aa  97.8  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  37.66 
 
 		 194 aa  94  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  41.61 
 
 		 175 aa  84.3  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  37.42 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  35.48 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  37.42 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  30.65 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.43 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  34.64 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  32.97 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  38.26 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  37.22 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  31.79 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.98 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  33.97 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  32.69 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  39.09 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  35.34 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  39.35 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.42 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  32.52 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0244  hypothetical protein  52.73 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.373808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 		 113 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 116 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  35.16 
 
 		 127 aa  52.8  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  40 
 
 		 703 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  39.29 
 
 		 703 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 132 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 113 aa  52  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1175  hypothetical protein  39.66 
 
 		 69 aa  51.6  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1051  rhodanese-like protein  33.91 
 
 		 122 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40.58 
 
 		 129 aa  51.6  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  30.09 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 		 123 aa  51.2  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2288  hypothetical protein  43.86 
 
 		 67 aa  50.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  33.7 
 
 		 99 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  32.99 
 
 		 136 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  44.32 
 
 		 398 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3724  hypothetical protein  45.61 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0417243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 119 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  32.35 
 
 		 149 aa  48.5  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.69 
 
 		 386 aa  48.5  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0993  hypothetical protein  41.82 
 
 		 67 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.984074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38 
 
 		 390 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1672  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.495158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1458  hypothetical protein  52 
 
 		 76 aa  47.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  37.08 
 
 		 123 aa  47.8  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  32.61 
 
 		 99 aa  47.8  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 		 257 aa  47.8  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  30.26 
 
 		 98 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  39.73 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 120 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 		 379 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.91 
 
 		 393 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 		 386 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  38.36 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  38.36 
 
 		 130 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  32.63 
 
 		 114 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 		 471 aa  45.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 		 102 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>