239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1051 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1051  rhodanese-like protein  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  81.15 
 
 		 122 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  83.47 
 
 		 126 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  61.67 
 
 		 120 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  42.61 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  40.35 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.67 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  39.42 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  36.78 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  36.94 
 
 		 175 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  36.94 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  36.94 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  36.94 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  36.94 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  38 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  37.29 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  37.29 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  36.44 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  36.44 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  36.44 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  39.08 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  35.59 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  35.59 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  35.59 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  34.29 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  32.38 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  35.42 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  32.41 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.35 
 
 		 400 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.35 
 
 		 400 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.35 
 
 		 400 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  39.22 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  31.3 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  33.93 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.88 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.35 
 
 		 392 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  33.66 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  29.73 
 
 		 194 aa  50.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 		 476 aa  50.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.25 
 
 		 390 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0533  rhodanese-like protein  32.79 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298777  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  33 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  30.97 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  35.06 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  31.03 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  35.8 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  29.17 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.31 
 
 		 387 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.71 
 
 		 392 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.58 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  27.88 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.14 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.05 
 
 		 386 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  37.84 
 
 		 346 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.63 
 
 		 386 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.63 
 
 		 379 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  33.03 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 271 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  26.96 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  35.65 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.38 
 
 		 393 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 392 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.677298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>