83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1268 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 
368 aa  700    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  54.89 
 
 
357 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  53.1 
 
 
360 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.86 
 
 
351 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  50.14 
 
 
351 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.06 
 
 
373 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.03 
 
 
373 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  37.24 
 
 
371 aa  186  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.01 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.23 
 
 
373 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.6 
 
 
371 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.61 
 
 
371 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  33.98 
 
 
371 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  39.64 
 
 
352 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  35.16 
 
 
367 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.58 
 
 
368 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  35.08 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  40.53 
 
 
400 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.13 
 
 
345 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.07 
 
 
423 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  32.88 
 
 
420 aa  165  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.01 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.2 
 
 
423 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.01 
 
 
374 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3923  hypothetical protein  37.21 
 
 
348 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.554926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  33.16 
 
 
421 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  39.2 
 
 
373 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.95 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.19 
 
 
400 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  34.57 
 
 
362 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  33.82 
 
 
363 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1528  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.95 
 
 
368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4955  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.14 
 
 
370 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1485  putative transmembrane protein  38.86 
 
 
374 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.27 
 
 
355 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.44 
 
 
374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.04 
 
 
363 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1966  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.26 
 
 
421 aa  126  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  35.29 
 
 
353 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.54 
 
 
364 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  32.16 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4145  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.28 
 
 
349 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689999  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  34.74 
 
 
366 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.8 
 
 
360 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  27.6 
 
 
344 aa  86.7  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.73 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  23.98 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  23.98 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.57 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  27 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  26.14 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  27.59 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  25.84 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  25.84 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.84 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  25.53 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  25.84 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  28.44 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  25.16 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.76 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  25.92 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  27.27 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.81 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  25.99 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.18 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.54 
 
 
416 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  34.19 
 
 
237 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.25 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.56 
 
 
402 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  19.28 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  36.28 
 
 
419 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.97 
 
 
171 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 
647 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.26 
 
 
187 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  33.72 
 
 
173 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.87 
 
 
176 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.65 
 
 
183 aa  45.8  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.13 
 
 
390 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.85 
 
 
180 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  32.58 
 
 
408 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  31.71 
 
 
408 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  28.12 
 
 
103 aa  42.7  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  29.11 
 
 
404 aa  42.7  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>