45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2939 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  683    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  42.28 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 325 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.39 
 
 		 322 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.87 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  33.13 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  35.09 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  33.93 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  33.13 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  33.64 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  35.67 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  32.73 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  32.92 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  32.6 
 
 		 326 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.53 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  31.14 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  31.89 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  30.51 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.79 
 
 		 326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  34.13 
 
 		 324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  32.59 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.13 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  31.27 
 
 		 339 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.02 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.23 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  32.42 
 
 		 334 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  29.57 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  30.58 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.65 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  28.87 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  31.49 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.08 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  22.64 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  25.28 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  36.62 
 
 		 116 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 106 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>