46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5360 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 337 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.82 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.65 
 
 		 326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  39.63 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.64 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  40.18 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  41.52 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  35.45 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  33.83 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  33.24 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  31.23 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  30.82 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.98 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.94 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  28.27 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  31.16 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  29.48 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.76 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  29.33 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  28.22 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5679  hypothetical protein  67.31 
 
 		 63 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  28.53 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  34.89 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  28.92 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  28.15 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  27.37 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  32.31 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  27.74 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 368 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  25.58 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 189 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 359 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  34.67 
 
 		 107 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  42.59 
 
 		 223 aa  42.7  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 		 114 aa  42.7  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>