42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1068 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 329 aa  650    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  37.61 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 320 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  34.76 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 325 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  33.13 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.8 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 333 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  32.34 
 
 		 329 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  30.12 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  32.31 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  28 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.28 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  30.56 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  30.37 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  30.85 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.06 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  27.02 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  28.94 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.75 
 
 		 326 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.7 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  31.84 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  27.14 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  29.13 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7771  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.15 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0374  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5360  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.22 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624321  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4648  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.67 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  27.18 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0416  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.43 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2987  transcriptional regulator, ArsR family  28.68 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3060  regulatory protein ArsR  32.69 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  24.08 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  23.18 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>