42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4199 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4199  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 323 aa  627  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000654261  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4678  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604348  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7936  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4248  regulatory protein, ArsR  38.72 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257853  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4137  transcriptional regulator, ArsR family  32.42 
 
 		 326 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1257  ArsR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0962048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2604  regulatory protein ArsR  34.06 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000170459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7744  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.49 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2939  hypothetical protein  33.02 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188076  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.66 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6816  ArsR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8265  transcriptional regulator, ArsR family  31.14 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6759  normal  0.106103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3074  transcriptional regulator, MarR family  32.44 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0987  transcriptional regulator, ArsR family  31.21 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5278  putative transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20560  ArsR family regulatory protein  31.61 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.192633  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02260  hypothetical protein  32.7 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01320  hypothetical protein  32.23 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3343  transcriptional regulator, ArsR family  32.06 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1068  transcriptional regulator, ArsR family  30.7 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5726  transcriptional regulator, MarR family  31.61 
 
 		 333 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367585  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.78 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5309  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8781  transcriptional regulator, ArsR family  32.42 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2023  transcriptional regulator, ArsR family  31.47 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968345  normal  0.0622762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5350  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.762712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  29.95 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4515  putative transcriptional regulator, ArsR family  28.02 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.980218  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3806  transcriptional regulator, ArsR family  30.52 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 137 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3377  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0559363  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7857  regulatory protein ArsR  26.57 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2907  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 122 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 114 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 126 aa  43.5  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6022  transcriptional regulator, ArsR family  28.29 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 		 171 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 109 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 124 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>