164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0967 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0967  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  357  5e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1661  regulatory protein ArsR  86.19 
 
 		 181 aa  293  1e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.921991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0252  ArsR family transcriptional regulator  85.64 
 
 		 181 aa  289  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1560  regulatory protein ArsR  60.56 
 
 		 180 aa  205  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.964745  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0129  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  41.77 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0166  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.789061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  39.47 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 127 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  39.68 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  36.49 
 
 		 114 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  41.18 
 
 		 107 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 121 aa  51.2  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 107 aa  51.2  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 115 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  30.23 
 
 		 104 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 115 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 		 127 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 122 aa  48.1  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 133 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 117 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 		 111 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 		 111 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  24.31 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0070  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.521136  normal  0.0282999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 		 112 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 125 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 113 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 		 102 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3026  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 347 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.775949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2727  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 347 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0462695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2708  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 347 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2254  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 347 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.205075 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2985  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 347 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000023297 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  37.7 
 
 		 100 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 126 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2778  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 347 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131129  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 105 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2989  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 347 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0140  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2990  transcriptional regulator, ArsR family  46.94 
 
 		 347 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 115 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  34.29 
 
 		 117 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 122 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 119 aa  45.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 85 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 106 aa  45.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 113 aa  44.7  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  35.38 
 
 		 121 aa  45.1  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 124 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 124 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 124 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 121 aa  45.1  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 341 aa  45.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  36.49 
 
 		 102 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2607  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 		 325 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334204  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 121 aa  44.7  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 128 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  32.43 
 
 		 127 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2783  ArsR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 346 aa  44.7  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.242907  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 341 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 102 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  37.88 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 108 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 102 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 102 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 104 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 102 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  30.26 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  30.26 
 
 		 125 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 102 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  32.39 
 
 		 92 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  36.49 
 
 		 102 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  31.88 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  30.26 
 
 		 125 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  36.49 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 305 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 341 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 437 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  36.49 
 
 		 102 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  38.46 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 102 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 131 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 108 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 337 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  38.46 
 
 		 100 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>