28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1512 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  39.61 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  34.83 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  45.76 
 
 		 192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  44.54 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1333  ArsR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 305 aa  72  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  26.36 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.22 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.95 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 269 aa  64.7  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  35.4 
 
 		 283 aa  64.7  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  37.4 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  34.74 
 
 		 409 aa  59.3  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  24.12 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 171 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0967  ArsR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  19.59 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3425  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 115 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5380  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 117 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 284 aa  41.2  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>