55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1234 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 225 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  35.81 
 
 		 255 aa  136  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  32.17 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 222 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  26.41 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  28.14 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  28.27 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  27.39 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  26.81 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  24.79 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  27.98 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  24.79 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  24.79 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  24.79 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  24.79 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  24.79 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  24.79 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  24.79 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  25.93 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  24.22 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  24.36 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  24.54 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  24.17 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  43.08 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  37.84 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  28.16 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3357  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.1 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  34.18 
 
 		 192 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1769  response regulator receiver and unknown domain-containing protein  39.66 
 
 		 223 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.870814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 209 aa  42.4  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>