44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1664 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  38.32 
 
 		 238 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  38.74 
 
 		 242 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  36.06 
 
 		 220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  39.7 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  42.99 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  32.7 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  21.84 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  23.77 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  25.89 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  23.77 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  25.89 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  25.89 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  23.77 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  23.77 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  25.45 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  25.45 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  23.67 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  31.75 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  33.95 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  33.5 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 284 aa  52  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  29.94 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  29.88 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  23.23 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>