60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2830 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  51.12 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  47.75 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  44.64 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  43.56 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  40.72 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  39.82 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  39.82 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  39.82 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  41.49 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  24.55 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  24.55 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  24.11 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  24.77 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  24.55 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  24.55 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  24.55 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  24.34 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  24.34 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  28.22 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  32.67 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  27.6 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  30.05 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 284 aa  52  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  32.84 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 		 271 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  31.52 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  31.61 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  32.31 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>