42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0715 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  100 
 
 
234 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  100 
 
 
234 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  100 
 
 
234 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  52.73 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  43.58 
 
 
212 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  39.01 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  38.12 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  37.56 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  37.44 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 
228 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  36.82 
 
 
209 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  40.89 
 
 
226 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 
241 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  30.33 
 
 
250 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  32.3 
 
 
238 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  23.26 
 
 
231 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  23.67 
 
 
231 aa  62  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  23.26 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  22.79 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  22.79 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  22.79 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  22.79 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  32.72 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  23.19 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  33.17 
 
 
227 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  22.33 
 
 
231 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  29.13 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  22.75 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  21.8 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  27.91 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 
284 aa  56.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  31.28 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  30.47 
 
 
224 aa  52.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  30.28 
 
 
233 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  26.76 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 
233 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0346  putative transcriptional regulator  40.58 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.20823  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>