54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0346 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0346  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  486  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.20823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  29.61 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  29.61 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  29.61 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  29.13 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  29.7 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  29.61 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  29.13 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  29.7 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  29.13 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  35.02 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  34.27 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  34.8 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  34.54 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  31.76 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  30.33 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  31.77 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  31.77 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11488  transcriptional regulator  31.12 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0037779  normal  0.99088 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  29 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  30.24 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  26.2 
 
 		 274 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  25.69 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  26.82 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4261  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 251 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>