50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5379 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  52.45 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  53.81 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  40.49 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  38.97 
 
 		 238 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  37.56 
 
 		 261 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  39.11 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  38.21 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  40.72 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  35.61 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  38.65 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  37.44 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  40.78 
 
 		 233 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  40.09 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 284 aa  92  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 266 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  34.23 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  37.39 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  24.08 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  24.39 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  23.68 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  23.16 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  23.68 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  23.68 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  23.16 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  23.16 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  24.72 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  26.8 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  22.63 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  22.63 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  28.49 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  29.95 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  28.25 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  27.41 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  30.64 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>