61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4860 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  433  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  53.92 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  51.2 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  38.92 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  40.29 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  35.41 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  37.38 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  37.19 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  35.1 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  38.73 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  30.88 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 284 aa  87.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  35.15 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  31.46 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  29.06 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  34.91 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  22.77 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  28.7 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  22.11 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  23.56 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  22.61 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  26.76 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  23.56 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  23.04 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  23.04 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  23.12 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  23.56 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  23.56 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  23.56 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  22.61 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  23.16 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  27 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  28.79 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  41.07 
 
 		 111 aa  45.1  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  30.68 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  28.49 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  26.7 
 
 		 242 aa  42  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  29.11 
 
 		 209 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3811  regulatory protein DeoR  44.9 
 
 		 396 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333022  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>