40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3645 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  460  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  52.36 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  51.53 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  45.58 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  47.75 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  39.21 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5497  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  38.12 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  38.12 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  38.12 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  36.4 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  24.26 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  33.17 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  24.89 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  24.45 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  24.67 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  24.23 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  24.67 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  23.58 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  24.23 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  24.23 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  24.23 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  24.23 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  23.79 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  28.99 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  25.33 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  28.17 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  27.92 
 
 		 238 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>