66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4305 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  47.53 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  45.37 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  33.76 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  41.06 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  37.56 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  37.56 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  37.56 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  35.41 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 222 aa  118  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  36.77 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  37.14 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  39.63 
 
 		 259 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  35.94 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  34.36 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  35.27 
 
 		 233 aa  96.3  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  32.64 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  32.02 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  21.63 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  26.88 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  34.54 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  31.16 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  22.86 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  27.69 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  23.39 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  30.32 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  25.67 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  24.34 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1166  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  32.42 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  29.78 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  24.89 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0346  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.20823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  26.6 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  39.74 
 
 		 211 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>