108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0414 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  458  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  45.93 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  45.05 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  28.08 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  28.08 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  27.09 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  29.21 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  28 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  26.11 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  27.09 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  28.02 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2387  transcriptional regulator protein-like protein  27.64 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.328356  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  26.9 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0307  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.519243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  28 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  25.89 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  24.87 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  23.86 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  26.13 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  24.62 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  25.99 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  25.91 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  23.38 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  24.51 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  24.51 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  24.51 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  24.51 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  24.51 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  24.51 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  24.51 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  23.23 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4801  putative transcriptional regulator  25.74 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2543  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0402  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  24.02 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  26.13 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  25.35 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  27.14 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2441  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.125946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1166  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  22.84 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  23.86 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5538  putative transcriptional regulator  22.97 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.912326  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  24.87 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11488  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0037779  normal  0.99088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0795  putative transcriptional regulator  23.08 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2732  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0409175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3678  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12072  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  22.84 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  21.32 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  21.32 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  21.46 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0888  putative transcriptional regulator  21.83 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  21.32 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  23.79 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2084  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  23.2 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  21.18 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  24.55 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  22.33 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  22.33 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2918  putative transcriptional regulator  23.92 
 
 		 265 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  22.33 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  24.24 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  23.94 
 
 		 274 aa  48.5  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  23.12 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  22.28 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  23.12 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  23.12 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  26.4 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>