30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2050 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  76.34 
 
 		 232 aa  342  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  64.71 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  35.85 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  35.38 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  27.75 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  43.08 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  27.68 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  32.28 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  27.6 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  25.63 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  25.77 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>