53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3487 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  46.61 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  46.64 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  46.76 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  42.98 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  43.05 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  38.57 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  38.73 
 
 		 215 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  40.78 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  40.78 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  40.78 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  37.38 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  37.44 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  32.87 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  35.92 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  33.8 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  23.81 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  24.34 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  35.36 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  24.34 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  24.34 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  24.34 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  33.71 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  28.86 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  33.16 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  28.99 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0346  putative transcriptional regulator  28.66 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.20823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  28.74 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  38.6 
 
 		 405 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>