64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3981 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  57.21 
 
 		 229 aa  187  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  47.56 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  46.64 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  41.42 
 
 		 242 aa  148  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  43.23 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  36.06 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  39.9 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  38.38 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  34.76 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  35.81 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  38.83 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  35.47 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  36.41 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  37.24 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  38.03 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 284 aa  75.1  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  30.66 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  28.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  34.84 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  22.73 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  27.46 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  29.68 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  28.33 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  26.94 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  23.96 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  23.44 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  23.96 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  23.44 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  27.23 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  23.44 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  22.92 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  28.33 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  23.44 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  20.94 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  42  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  22.92 
 
 		 231 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  33.04 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  22.92 
 
 		 231 aa  42  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  22.92 
 
 		 231 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 219 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>