35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4298 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  76.34 
 
 		 225 aa  342  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  65.4 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  33.93 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  33.51 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  29.51 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  26.86 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  25.28 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  27.92 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  21 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  33.52 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  31.58 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  40.58 
 
 		 212 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>