125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3726 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  88.63 
 
 
211 aa  387  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  55.17 
 
 
211 aa  221  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  33 
 
 
210 aa  131  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  31.53 
 
 
210 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
210 aa  124  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 
217 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  31.53 
 
 
210 aa  121  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  38.68 
 
 
280 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  35.86 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  35.86 
 
 
214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  37.76 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 
220 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  33.67 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  33.67 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  33.67 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  33.67 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  33.67 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  33.67 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 
253 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1166  putative transcriptional regulator  40.39 
 
 
221 aa  111  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  33.67 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  33.67 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  35.18 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  34.16 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  38.27 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  34.85 
 
 
274 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  33.99 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  31.39 
 
 
228 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  33.66 
 
 
204 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 
203 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  32.02 
 
 
238 aa  105  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  37.07 
 
 
208 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  33.49 
 
 
223 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
235 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 
254 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  31.19 
 
 
205 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 
217 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 
237 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  33 
 
 
217 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 
207 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5538  putative transcriptional regulator  32.68 
 
 
209 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.912326  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  33.33 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  31.53 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  32.02 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  32.69 
 
 
275 aa  99  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 
207 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  34.91 
 
 
248 aa  98.6  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  31.37 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 
273 aa  97.4  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  30.1 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 
225 aa  95.1  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16120  transcriptional regulator  36.7 
 
 
269 aa  95.1  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778634  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5988  putative transcriptional regulator  34.83 
 
 
270 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 
220 aa  95.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
207 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  31.53 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2964  putative transcriptional regulator  35.32 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2223  putative transcriptional regulator  34 
 
 
280 aa  93.2  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000435551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2732  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0409175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  30.29 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  30.29 
 
 
219 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  31.22 
 
 
214 aa  92.4  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4801  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 
207 aa  92  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2543  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 
199 aa  92  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  33.66 
 
 
240 aa  92  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 
210 aa  91.3  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  33.49 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  29.56 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5155  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 
238 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  29.56 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  29.56 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  34.29 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  34.29 
 
 
238 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  34.29 
 
 
238 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  30.33 
 
 
236 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3678  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 
245 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2084  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 
291 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  29.06 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2341  putative transcriptional regulator  32.37 
 
 
270 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0888  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 
211 aa  85.9  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1659  putative transcriptional regulator  33.01 
 
 
308 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.773243  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  31.48 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11480  predicted transcriptional regulator  32 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>