68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2106 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  57.5 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  47.53 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  42.23 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  41.95 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  36.8 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  43.54 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  42.23 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  40.61 
 
 		 242 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  36.02 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  35.12 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  34.93 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  40.2 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  31.53 
 
 		 266 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  33.49 
 
 		 259 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  32.88 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  29.63 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  29.63 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  29.86 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0753  hypothetical protein  32.24 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  29.09 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  26.36 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  27.7 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  28.84 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  28.84 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  28.84 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1629  putative transcriptional regulator  25.6 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.346983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  31.49 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  33.18 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  28.73 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  23.63 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  26.13 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  28.06 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2296  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000358822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3357  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.83 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  38.27 
 
 		 390 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>