70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2793 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3240  putative transcriptional regulator  53.88 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  47.32 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2106  transcriptional regulator  42.72 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317917  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0501  transcriptional regulator  42.36 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4860  transcriptional regulator  39.61 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.447451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2939  hypothetical protein  38.07 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000205153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12640  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5848  putative transcriptional regulator  41.63 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4755  putative transcriptional regulator  39.63 
 
 		 228 aa  121  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.832401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3634  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0113187  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5290  transcriptional regulator  39.15 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5669  transcriptional regulator  39.15 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5379  transcriptional regulator  39.15 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3651  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000276569  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1766  putative transcriptional regulator  39.09 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  decreased coverage  0.00244734 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1234  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3145  transcriptional regulator, TrmB  38.81 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0580326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1344  transcriptional regulator  38.21 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0152  putative transcriptional regulator  33.63 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.374719  normal  0.615792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3981  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.340419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0201  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2372  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4098  putative transcriptional regulator  25.84 
 
 		 231 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000232031  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  33.64 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3996  hypothetical protein  28.16 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000015426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4265  hypothetical protein  28.16 
 
 		 231 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4375  hypothetical protein  28.78 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00420257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0878  hypothetical protein  27.05 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000881272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4356  hypothetical protein  27.8 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4322  hypothetical protein  28.29 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00652041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4146  hypothetical protein  27.67 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000836858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3986  hypothetical protein  27.8 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4467  hypothetical protein  27.67 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648932  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1638  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2973  putative transcriptional regulator  25.6 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3487  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495676  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0236  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0276  putative transcriptional regulator  34.13 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.209472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4298  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4852  hypothetical protein  28.7 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1664  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.106955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4406  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2050  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.483871  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0721  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0735  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.139797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0715  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.277426  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3352  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3645  putative transcriptional regulator  28.83 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000603438  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2638  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.537278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5865  putative transcriptional regulator  26.39 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2731  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  31.93 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  27.49 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.09 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12637  hypothetical protein  26.13 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00143297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  28.49 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 110 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  23.9 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  23.9 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2830  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.839532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>