64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1322 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 
214 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  49.67 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  40.11 
 
 
198 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
180 aa  121  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  37.84 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  36.32 
 
 
227 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  40.11 
 
 
198 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  40.22 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.22 
 
 
213 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.87 
 
 
243 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 
224 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 
192 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
206 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  40.94 
 
 
201 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  33.33 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  36.97 
 
 
230 aa  91.7  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
193 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  33.16 
 
 
183 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
187 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  35.16 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
182 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  32.78 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  39.67 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  31.34 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  46.03 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  47.37 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  31.03 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  30.21 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
194 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  34.85 
 
 
102 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.891597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
102 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
102 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
101 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4550  hypothetical protein  32.35 
 
 
131 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.167859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  36.07 
 
 
226 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 
248 aa  45.1  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0006  regulatory protein, ArsR  40.98 
 
 
98 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  33.8 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  33.8 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  39.73 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
117 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  28.46 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 
106 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 
171 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  29.85 
 
 
206 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  44.78 
 
 
113 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
135 aa  41.6  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  29.85 
 
 
206 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
132 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  33.8 
 
 
207 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  29.85 
 
 
206 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 
114 aa  41.6  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>