40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3356 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  37.77 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.81 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  51.19 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  32.2 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  30.67 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  38.27 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  30.85 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  26.29 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  30.81 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.78 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  27.33 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  30.49 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  42.19 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  35.38 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  40.24 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  35.38 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 226 aa  44.7  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  24.34 
 
 		 472 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  27.72 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  28.26 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  29.03 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  39.73 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  39.19 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 230 aa  41.6  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>