87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5019 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  36.32 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  38.67 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  37.16 
 
 		 180 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  35.08 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.12 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  32.83 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  37.24 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  32.54 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  37.71 
 
 		 192 aa  92.4  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  38.89 
 
 		 196 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  35 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  37.16 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  32.22 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  33.54 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  29.51 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  29.78 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  42.31 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  33.51 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  32.06 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  36.44 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  27.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  29.12 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  29.48 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 102 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.891597 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  28.4 
 
 		 472 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  34.43 
 
 		 95 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  27.72 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  27.72 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  27.72 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  27.49 
 
 		 183 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  41.38 
 
 		 107 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  28.72 
 
 		 196 aa  45.1  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.76 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 108 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3450  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 106 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 120 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 150 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 		 107 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  29.73 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 112 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 118 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 117 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 		 399 aa  42.4  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 105 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  30.38 
 
 		 104 aa  42.4  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 107 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  32.81 
 
 		 114 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 207 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 107 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 207 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 207 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 207 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 		 106 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  36.36 
 
 		 253 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>