43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2852 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  40.76 
 
 
232 aa  148  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.87 
 
 
243 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.44 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 
206 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  34 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  35.64 
 
 
196 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  34.2 
 
 
180 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  30.56 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  33.18 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  49.3 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  33.51 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  33.7 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  30.41 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  29.95 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  34.55 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  30.6 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  28.57 
 
 
197 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  46.38 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.63 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  31.55 
 
 
201 aa  62  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  40.7 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  27.03 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  31.12 
 
 
206 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  28.73 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  31.4 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  43.28 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  29.08 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  38.16 
 
 
187 aa  52.4  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 
119 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  31.16 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 
97 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
200 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
119 aa  42.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
194 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 
107 aa  41.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>