67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1862 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  42.56 
 
 
193 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  37.22 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
227 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
224 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  38.98 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  36.84 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  36.11 
 
 
196 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  36.88 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  37.64 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
187 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 
243 aa  84.7  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  51.81 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  34.32 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  43.88 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  32.75 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  32.05 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  33.52 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  33.55 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  32.9 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  33.12 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  39 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  31.46 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  34.42 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  42.19 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  31.64 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
195 aa  51.6  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  31.82 
 
 
107 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  31.82 
 
 
107 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  32.86 
 
 
306 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  36.47 
 
 
109 aa  45.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  21.88 
 
 
188 aa  45.1  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
108 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  21.88 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1079  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
110 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0278523  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  37.7 
 
 
123 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2967  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 
183 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
123 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  38.33 
 
 
114 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  24.14 
 
 
472 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  29.94 
 
 
183 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
112 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
113 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  31.75 
 
 
109 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
111 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
130 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2793  transcriptional regulator  36.71 
 
 
224 aa  42  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
188 aa  42  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
93 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 
97 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
123 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>