29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05590 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  32.95 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  29.35 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.64 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  25.9 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  26.71 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  27.78 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  25.88 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1537  ArsR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  34.88 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  23.42 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  24.05 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  23.42 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  31.13 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  23.9 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 213 aa  42  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  22.78 
 
 		 149 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  22.78 
 
 		 149 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  34.94 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>