44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2260 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 183 aa  363  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27620  predicted transcriptional regulator  47.22 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2967  transcriptional regulator, ArsR family  41.13 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1437  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 162 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2815  ArsR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.897524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  31.61 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1537  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 112 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  33.64 
 
 		 225 aa  48.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 472 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  21.38 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  27.49 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 		 399 aa  45.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  27.74 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  20.75 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3725  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  0.384305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.07 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  26.36 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  28.46 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  28.05 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  35.63 
 
 		 370 aa  42.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  29.12 
 
 		 201 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 216 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 182 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 230 aa  42  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 107 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06390  ArsR family regulatory protein  39.51 
 
 		 182 aa  42  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 93 aa  41.6  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 		 111 aa  41.2  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>