112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0259 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4216  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.141181  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  32.42 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  33.73 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1537  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  32.14 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  32.14 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2967  transcriptional regulator, ArsR family  30.46 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  21.08 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  20.48 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1526  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  42.62 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  20.89 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0140  Fis family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 181 aa  48.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  29.85 
 
 		 208 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 196 aa  47.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3725  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  0.384305 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  34.75 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  22.08 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  31.58 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 223 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  35.21 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8175  hypothetical protein  38.67 
 
 		 324 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 120 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 114 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27620  predicted transcriptional regulator  28.21 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  28.76 
 
 		 211 aa  44.3  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 		 115 aa  44.7  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  44.3  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  38.46 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 103 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2991  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  30.91 
 
 		 336 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  28.05 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3026  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.775949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2778  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2727  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0462695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2708  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  34.92 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2989  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0967  ArsR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  40.35 
 
 		 118 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  40.35 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2985  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000023297 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2846  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  35.94 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  36.62 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2990  transcriptional regulator, ArsR family  32.81 
 
 		 347 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 		 234 aa  42.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 123 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 89 aa  42.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 105 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  43.14 
 
 		 120 aa  41.6  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2254  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 347 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.205075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  27.5 
 
 		 243 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  39.62 
 
 		 120 aa  41.6  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  34.72 
 
 		 113 aa  41.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 125 aa  41.6  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 125 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 125 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 125 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 97 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 125 aa  41.2  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1236  ArsR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 217 aa  41.2  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.348841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0775  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.394099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3025  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 347 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.775096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>